Le Conservatoire royal de Bruxelles possède un patrimoine important d’instruments de grande qualité. Depuis quelques années, les instruments sont commandés, restaurés et adaptés pour être en adéquation avec les recherches organologiques récentes.
Le département Musique ancienne dispose de nombreux instruments issus de ce patrimoine : instruments à cordes (violons, violoncelles à quatre et cinq cordes, basse de violon, contrebasse...), archets, instruments à vent (flûtes à bec, basson, cors, hautbois, traversos...) et claviers (orgues, clavecins, pianoforte...). Ce parc instrumental est un véritable outil de recherche pratique mis à la disposition des étudiants en fonction des besoins des différentes classes.
Un système de prêts interne au département Musique ancienne permet l’échange régulier des instruments. Cette souplesse favorise l’utilisation des instruments adaptés aux répertoires des étudiants.